RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 NFYCQ13952 458 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 RABL3Q5HYI8 236 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TBPL2Q6SJ96 375 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 BPIFA2Q96DR5 249 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 Q96M85 177 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TBX15Q96SF7 602 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 PCGF1Q9BSM1 259 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 WDR76Q9H967 626 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 NOX4Q9NPH5 578 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TUBG2Q9NRH3 451 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 RHCGQ9UBD6 479 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 SNX13Q9Y5W8 968 aa7□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 GMNCA6NCL1 334 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 OR6C6A6NF89 314 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 A6NIZ1 184 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 J3KTA2 159 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 IFNL4K9M1U5 179 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 M0QZ24 198 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CDC42EP2O14613 210 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FFAR1O14842 300 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TIMM23O14925 209 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 ANGPT2O15123 496 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 RER1O15258 196 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FCN3O75636 299 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CLPXO76031 633 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 IGHV4-59P01825 116 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 MMP9P14780 707 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CTLA4P16410 223 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CPT2P23786 658 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CFHR2P36980 270 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 PSMB10P40306 273 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 PROK1P58294 105 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 RAP1BP61224 184 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 RAP1AP62834 184 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 PRKCDQ05655 676 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 MPPED2Q15777 294 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TAF9Q16594 264 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 MESTQ5EB52 335 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 GPR157Q5UAW9 335 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 NAA40Q86UY6 237 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 NRMQ8IXM6 262 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FNDC8Q8TC99 324 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF583Q96ND8 569 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 OR8B2Q96RD0 313 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 WACQ9BTA9 647 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CTSZQ9UBR2 303 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CLN8Q9UBY8 286 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 BAG5Q9UL15 447 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0U1RQK1 487 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1B0GWJ7 208 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 B2RBV5 119 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 GPR137BO60478 399 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FAM20BO75063 409 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 PTP4A3O75365 173 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FSTL3O95633 263 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 NR2C1P13056 603 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 GATA4P43694 442 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 BPIFB3P59826 476 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 HIST1H3AP68431 136 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 MEP1BQ16820 701 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FBLN7Q53RD9 439 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 TTMPQ5BVD1 217 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 Q6ZSV7 163 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-208ENST00000479480 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms