RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SEC22AQ96IW7 307 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 KCNK17Q96T54 332 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 EMC6Q9BV81 110 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 COA4Q9NYJ1 87 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 MED11Q9P086 117 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 CKLFQ9UBR5 152 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 CYB5AP00167 134 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 HPP00738 406 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ISG15P05161 165 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 DCAF7P61962 342 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 HSD11B2P80365 405 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 TOMM20Q15388 145 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OR7A5Q15622 319 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 PCK2Q16822 640 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 BEX5Q5H9J7 111 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 C1orf100Q5SVJ3 147 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 AQP3Q92482 292 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SOX7Q9BT81 388 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 VDAC3Q9Y277 283 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 RNF222A6NCQ9 220 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OR5H14A6NHG9 310 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 LINC00587B1AMM8 73 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SULT1C2O00338 296 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 EFNA2O43921 213 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF217O75362 1048 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 AHSA1O95433 338 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 CD8AP01732 235 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 TTRP02766 147 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 DNASE1L1P49184 302 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 MEOX2P50222 304 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 QRFPP83859 136 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 TDGQ13569 410 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SYT13Q7L8C5 426 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF546Q86UE3 836 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 THRSPQ92748 146 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 FGGYQ96C11 551 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF75AQ96N20 296 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 CST11Q9H112 138 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 CENPMQ9NSP4 180 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 LMO7DNF2Z398 122 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 AQP8O94778 261 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 CRABP1P29762 137 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 PPP1R1AQ13522 171 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 COX15Q7KZN9 410 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 FJX1Q86VR8 437 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 BEST3Q8N1M1 668 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 MVB12AQ96EY5 273 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SPACA5Q96QH8 159 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
C9orf3-214ENST00000473778 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms