RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 C3orf80F5H4A9 247 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 FAM20BO75063 409 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 PTP4A3O75365 173 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 FCN3O75636 299 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DIRAS1O95057 198 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R3DO95685 299 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SERPINA1P01009 418 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 KNG1P01042 644 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 FPR3P25089 353 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 LIPEQ05469 1076 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 MAB21L1Q13394 359 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SEC23BQ15437 767 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.32□□□□□ -0.92
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ACTB-209ENST00000473257 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.32□□□□□ -0.92
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ACTB-209ENST00000473257 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 TECTBQ96PL2 329 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 OR8B2Q96RD0 313 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
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ACTB-209ENST00000473257 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 MIOXQ9UGB7 285 aa9.32□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.31□□□□□ -0.92
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ACTB-209ENST00000473257 MELTFP08582 738 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 IFI44LQ53G44 452 aa9.31□□□□□ -0.92
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ACTB-209ENST00000473257 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 BRICD5Q6PL45 260 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHA8Q96JA3 519 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 TBX15Q96SF7 602 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SLITRK2Q9H156 845 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 TMEM100Q9NV29 134 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 CLN8Q9UBY8 286 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.31□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.3□□□□□ -0.92
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ACTB-209ENST00000473257 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SRRM5B3KS81 715 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 F5H5K5 113 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 GSTA4O15217 222 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 NDUFB2O95178 105 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 IGHV4-59P01825 116 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 ACSM4P0C7M7 580 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 PSKH1P11801 424 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 CA6P23280 308 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SDHAP31040 664 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 IFNA8P32881 189 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 CFHR2P36980 270 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 OMPP47874 163 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SLC7A2P52569 658 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DLX1P56177 255 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H3AP68431 136 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 COQ5Q5HYK3 327 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 Q6YL49 198 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 OR6V1Q8N148 313 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 OR52J3Q8NH60 311 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 LZICQ8WZA0 190 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTB-209ENST00000473257 PKP2Q99959 881 aa9.3□□□□□ -0.92
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