RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.79	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GVG6	124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	TTLL8	A6PVC2	850 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435		F5H5K5	113 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435		K7ENP7	123 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435		M0R135	149 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNHIT1	O43257	154 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	SYNGR3	O43761	229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	LMX1B	O60663	402 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM127	O75204	238 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	WISP2	O76076	250 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	PAH	P00439	452 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF12	P17014	697 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	ELK1	P19419	428 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC6A9	P48067	706 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	MADCAM1	Q13477	382 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF774	Q6NX45	483 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	PGAM5	Q96HS1	289 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	GLRX2	Q9NS18	164 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	LUZP4	Q9P127	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	MALT1	Q9UDY8	824 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	PRSS50	Q9UI38	385 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435	MED12L	Q86YW9	2145 aa		10.78	□□□□□ -0.68
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GTI1	187 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	OR14I1	A6ND48	311 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	APOC1	P02654	83 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	DBH	P09172	617 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	PATE4	P0C8F1	98 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	CRYGS	P22914	178 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	ANOS1	P23352	680 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	TALDO1	P37837	337 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	HTR5A	P47898	357 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	EVX1	P49640	407 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	PSMD7	P51665	324 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	TMPRSS3	P57727	454 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	PSG4	Q00888	419 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	FAP	Q12884	760 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	ECH1	Q13011	328 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	IL18	Q14116	193 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	TBR1	Q16650	682 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC36A2	Q495M3	483 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	PYDC2	Q56P42	97 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	STEAP3	Q658P3	488 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		10.77	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A096LPE4	126 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PPZ6	126 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	ISPD	A4D126	451 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6C6	A6NF89	314 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	APOA1	P02647	267 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	CALCB	P10092	127 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF20	P17024	532 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL1	P22362	96 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	CFP	P27918	469 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	OR3A2	P47893	321 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	TPTE	P56180	551 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	CLDN12	P56749	244 aa		10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
HDLBP-231	ENST00000467435	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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