RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 DRAM2Q6UX65 266 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 BIVMQ86UB2 503 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF786Q8N393 782 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM163Q8TC26 289 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 CMBLQ96DG6 245 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNJ15Q99712 375 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 TPK1Q9H3S4 243 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF878C9JN71 531 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 M0R135 149 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ADH4P08319 380 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC15A1P46059 708 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF81P51508 661 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RAD23AP54725 363 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 APOFQ13790 326 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OTOSQ8NHW6 89 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 STMN2Q93045 179 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF799Q96GE5 643 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DIRC2Q96SL1 478 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD6Q9BV23 337 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 POFUT1Q9H488 388 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TOR3AQ9H497 397 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPMQ9NSP4 180 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PLSCR5A0PG75 271 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 VWC2LB2RUY7 222 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF223E7ERA6 249 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 EI24O14681 340 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LCATP04180 440 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GIFP27352 417 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TAF13Q15543 124 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM209AQ5JX71 171 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NAA40Q86UY6 237 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CBR4Q8N4T8 237 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RDH5Q92781 318 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 COPS4Q9BT78 406 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.38□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC182A6NF36 153 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 E9PQ18 207 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 BAG2O95816 211 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 APOC1P02654 83 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 HPXP02790 462 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ALOX5APP20292 161 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MALLQ13021 153 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GGTLC2Q14390 218 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GID4Q8IVV7 300 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS13CQ709C8 3753 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A096LNT2 108 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SELENOFO60613 162 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV1-46P01743 117 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LYNP07948 512 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SELEP16581 610 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OPRL1P41146 370 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NR4A2P43354 598 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEB1P43366 347 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC42P60953 191 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK5R2Q13319 367 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC29A1Q99808 456 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SP140LQ9H930 580 aa14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms