RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PHB2Q99623 299 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GVT2 93 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5H15A6NDH6 313 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TVP23AA6NH52 213 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5H1A6NKK0 313 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 RCBTB2O95199 551 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T7P0C7T2 308 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINA4P29622 427 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CRABP1P29762 137 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 BSGP35613 385 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 RAP1AP62834 184 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF627Q7L945 461 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2L13Q8N349 312 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T27Q8NH04 317 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 IL17FQ96PD4 163 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR7D2Q96RA2 312 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A7Q99884 636 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PS29 197 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MWP6 167 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PF4P02776 101 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 C8AP07357 584 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MELTFP08582 738 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SRFP11831 508 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 AKR1C4P17516 323 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SPINT3P49223 89 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ADPRHP54922 357 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 GKN2Q86XP6 184 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 GPX8Q8TED1 209 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM239Q8WW34 195 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR34Q96EX3 536 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MVB12AQ96EY5 273 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 Q96M85 177 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5B2Q96R09 309 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 LMF1Q96S06 567 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A13Q99584 98 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MXE2 369 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BKO60814 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BJP06899 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF735P0CB33 412 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A1P11166 492 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BOP23527 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BBP33778 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 GJA4P35212 333 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PPICP45877 212 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PDX1P52945 283 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BDP58876 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R38P59533 333 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BCP62807 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 GAS6Q14393 721 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MESTQ5EB52 335 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MITD1Q8WV92 249 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 NTNG2Q96CW9 530 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 BPIFA2Q96DR5 249 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 NRTNQ99748 197 aa7.55□□□□□ -1.2
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