RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439406.5

HCG20-208, Transcript of HLA complex group 20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG20, Length 1,202 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG20-208ENST00000439406 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 RHCGQ9UBD6 479 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 ASF1AQ9Y294 204 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.61□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SCN2AQ99250 2005 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 A8MUA0 341 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 E9PQ18 207 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 M0R233 179 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CDC7O00311 574 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 AKR7A2O43488 359 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 XPNPEP2O43895 674 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 MPZL2O60487 215 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CLN5O75503 358 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CCNB2O95067 398 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 NDUFB4O95168 129 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 LY6G6DO95868 133 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SFTPBP07988 381 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 FGF2P09038 288 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 MAGP20916 626 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 DPP4P27487 766 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SDC2P34741 201 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 MAGEA2P43356 314 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 TGM4P49221 684 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PPP3R1P63098 170 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 DHODHQ02127 395 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PUDPQ08623 228 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 OR1C1Q15619 314 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 ETFDHQ16134 617 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 MICBQ29980 383 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 RNF212Q495C1 297 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CDNFQ49AH0 187 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SAXO2Q658L1 398 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SPINK14Q6IE38 97 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SHFQ7M4L6 423 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CDC20BQ86Y33 519 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SKA3Q8IX90 412 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 BEST3Q8N1M1 668 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PQLC3Q8N755 202 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 ZNF675Q8TD23 568 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 OR14A2Q96R54 314 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CD274Q9NZQ7 290 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 HIVEP2P31629 2446 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 A0A1B0GTH9 108 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 LINC00587B1AMM8 73 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 VWC2LB2RUY7 222 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PRSS46E5RG02 174 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 ZNF264O43296 627 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 LYRM1O43325 122 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 KIAA0513O60268 411 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 AP2A2O94973 939 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CELA2AP08217 269 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 FBP1P09467 338 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 CSF3P09919 207 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 TSPAN19P0C672 248 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 RAB4AP20338 218 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 MAOAP21397 527 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 FMO3P31513 532 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PRDX2P32119 198 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 MMP15P51511 669 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 ERVK-8P63133 956 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 HSF1Q00613 529 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 PMPCAQ10713 525 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 GAGE2BQ13066 116 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HCG20-208ENST00000439406 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms