RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM15	Q9C019	465 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TG	P01266	2768 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIAL4D	F5H284	164 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	BHLHE40	O14503	412 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SURF4	O15260	269 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1B2	P21281	511 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NOS3	P29474	1203 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GGT2	P36268	569 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MNAT1	P51948	309 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T2	Q6IF00	324 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5AS1	Q8N127	324 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8G5	Q8NG78	346 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FN3K	Q9H479	309 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IL20	Q9NYY1	176 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		14.93	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GWJ7	208 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSM4	P0C7M7	580 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MXRA7	P84157	204 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC36A3	Q495N2	470 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00471	Q8N535	108 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GCM1	Q9NP62	436 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF11B	O00300	401 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MLNR	O43193	412 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXH1	O75593	365 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GAST	P01350	101 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SBK2	P0C263	348 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP16	P51512	607 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	BTG1	P62324	171 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LCN2	P80188	198 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ECH1	Q13011	328 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZMYND11	Q15326	602 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	AWAT1	Q58HT5	328 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR31	Q5SQ13	230 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LCN8	Q6JVE9	175 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SPIC	Q8N5J4	248 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ST7L	Q8TDW4	575 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ATF6B	Q99941	703 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC13	Q9H3R2	512 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OPN4	Q9UHM6	478 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		14.91	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MXK9	166 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		B2RBV5	119 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM178B	H3BS89	294 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FSHB	P01225	129 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NAA40	Q86UY6	237 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NSL1	Q96IY1	281 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP6	Q96JE9	813 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PITX2	Q99697	317 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		14.9	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		F5H5K5	113 aa		14.89	□□□□□ -0.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms