RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409483.5

PTPRN2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-205ENST00000409483 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 OIP5O43482 229 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 FAHP16930 419 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 TMUB2Q71RG4 321 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 WDFY2Q96P53 400 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ENY2Q9NPA8 101 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 MED12Q93074 2177 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 TMEM221A6NGB7 291 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 PGAP1Q75T13 922 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 OR5AS1Q8N127 324 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 RER1O15258 196 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF254O75437 659 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 RAC2P15153 192 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 IL9P15248 144 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ACSM1Q08AH1 577 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 CLINT1Q14677 625 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 EXT1Q16394 746 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ESCO2Q56NI9 601 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 EFSO43281 561 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ANGPTL7O43827 346 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 CD46P15529 392 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 CCL11P51671 97 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF79Q15937 498 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 THEM4Q5T1C6 240 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 MBTPS2O43462 519 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC34A2O95436 690 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 PCK2Q16822 640 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRN2-205ENST00000409483 IGHV4-34P06331 123 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 CT45A8P0DMV1 189 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 CT45A9P0DMV2 189 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 GCH1P30793 250 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 CRYBA2P53672 197 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 PDCD1Q15116 288 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 LRFN1Q9P244 771 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 PRKACBP22694 351 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 PPT1P50897 306 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 MMP15P51511 669 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 DYRK1AQ13627 763 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 C4orf45Q96LM5 186 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 OR6C76A6NM76 312 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 MSL3P1P0C860 447 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 FCARP24071 287 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 Q7L0L9 218 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 DOK3Q7L591 496 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 NAXDQ8IW45 347 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 A0A0D9SG52 128 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 FOXS1O43638 330 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 ICMTO60725 284 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 RGS11O94810 467 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 IGKV1D-16P01601 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF728P0DKX0 622 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 FOXK1P85037 733 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF141Q15928 474 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 BPNT1O95861 308 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 NXPH1P58417 271 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 ST3GAL2Q16842 350 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 LANCL2Q9NS86 450 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 RLFQ13129 1914 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 ALX3O95076 343 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRN2-205ENST00000409483 CHRM2P08172 466 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms