RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.66□□□□□ -0.54
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PTPRN-202ENST00000409251 SMCO4Q9NRQ5 59 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-202ENST00000409251 FLRT3Q9NZU0 649 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-202ENST00000409251 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.66□□□□□ -0.54
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PTPRN-202ENST00000409251 ZNF205O95201 554 aa11.66□□□□□ -0.54
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PTPRN-202ENST00000409251 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRN-202ENST00000409251 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-202ENST00000409251 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-202ENST00000409251 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-202ENST00000409251 AMELYQ99218 206 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRN-202ENST00000409251 GPRIN2O60269 458 aa11.65□□□□□ -0.55
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PTPRN-202ENST00000409251 RGS19P49795 217 aa11.65□□□□□ -0.55
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PTPRN-202ENST00000409251 FAM53BQ14153 422 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 SGCAQ16586 387 aa11.65□□□□□ -0.55
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PTPRN-202ENST00000409251 OR2L13Q8N349 312 aa11.65□□□□□ -0.55
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PTPRN-202ENST00000409251 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 WNT11O96014 354 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 ABOP16442 354 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 TLE1Q04724 770 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 ARFRP1Q13795 201 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 KIR2DS3Q14952 304 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 AWAT1Q58HT5 328 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 OR14K1Q8NGZ2 314 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-202ENST00000409251 CYYR1Q96J86 154 aa11.64□□□□□ -0.55
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