RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFSF14O43557 240 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GABRB1P18505 474 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HTR2CP28335 458 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGEA12P43365 314 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A8P48029 635 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4D2P58180 307 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CXADRP78310 365 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LGSNQ5TDP6 509 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR7G2Q8NG99 324 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 VOPP1Q96AW1 172 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ODAMA1E959 279 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM235A6NFC5 223 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BML4 177 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS23O95084 383 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CDKN2BP42772 138 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NOVP48745 357 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CRADDP78560 199 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 IRF9Q00978 393 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ST3GAL2Q16842 350 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2FQ969M7 185 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FZD8Q9H461 694 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF205O95201 554 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFB10O96000 172 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PF4P02776 101 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKACGP22612 351 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GFRA1P56159 465 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R30P59541 319 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35A2P78381 396 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 VAMP3Q15836 100 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF157Q96PX1 679 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PBX4Q9BYU1 374 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GAGE12BA1L429 117 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SERINC4A6NH21 518 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ARPC2O15144 300 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SCG5P05408 212 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 EBLN1P0CF75 366 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TIRAPP58753 221 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TLE3Q04726 772 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 KEAP1Q14145 624 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1Q1Q15612 314 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ACSM6Q6P461 480 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 M1APQ8TC57 530 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CMBLQ96DG6 245 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GUCD1Q96NT3 240 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OXSMQ9NWU1 459 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM159BA6NKW6 160 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPB2A8KAH6 182 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 B4DGG1 531 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LRATO95237 230 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC2A5P22732 501 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ACP1P24666 158 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GDF1P27539 372 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK5R2Q13319 367 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXE3Q13461 319 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPB2Q16082 182 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NRN1LQ496H8 165 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM123Q8N131 208 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 THAP4Q8WY91 577 aa6.09□□□□□ -1.43
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