RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 DEFB119Q8N690 84 aa16.27■□□□□ 0.2
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SPNS3-201ENST00000355530 SLC5A6Q9Y289 635 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 SEC16AO15027 2179 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 RAB3AP20336 220 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 CNR1P21554 472 aa16.24■□□□□ 0.19
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SPNS3-201ENST00000355530 PRKXP51817 358 aa16.24■□□□□ 0.19
SPNS3-201ENST00000355530 LBX1P52954 281 aa16.24■□□□□ 0.19
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