RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 SCAND1P57086 179 aa14□□□□□ -0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14□□□□□ -0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 TAF9BQ9HBM6 251 aa14□□□□□ -0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 OR1S2Q8NGQ3 325 aa13.98□□□□□ -0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRU-201ENST00000345512 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.97□□□□□ -0.17
PTPRU-201ENST00000345512 IFNA5P01569 189 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRU-201ENST00000345512 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRU-201ENST00000345512 ISXQ2M1V0 245 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRU-201ENST00000345512 PRSS35Q8N3Z0 413 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRU-201ENST00000345512 TERB2Q8NHR7 220 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRU-201ENST00000345512 ULBP2Q9BZM5 246 aa13.97□□□□□ -0.17
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