RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336596.6

EPHA3-201, Transcript of EPH receptor A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EPHA3, Length 5,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3-201ENST00000336596 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 GHITMQ9H3K2 345 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 TMEM210A6NLX4 147 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 ACP1P24666 158 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SPOCK1Q08629 439 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 FOXF1Q12946 379 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 NUP37Q8NFH4 326 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 OR52N1Q8NH53 320 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 OR52N5Q8NH56 324 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 EID2BQ96D98 161 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SCN5AQ14524 2016 aa6.64□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 A0A0A6YYD5 115 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 A0A1W2PQF6 199 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 CT45A10P0DMU9 189 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 FGF5P12034 268 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PTAFRP25105 342 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 DUSP5Q16690 384 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 OR5AS1Q8N127 324 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SPSB1Q96BD6 273 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 CCL19Q99731 98 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 GINS3Q9BRX5 216 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PECRQ9BY49 303 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 CTSFQ9UBX1 484 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SERTM1A2A2V5 107 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 OR5B21A6NL26 309 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 J3QRK9 145 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 HAX1O00165 279 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 RRASP10301 218 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 TNFRSF1BP20333 461 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 MESP2Q0VG99 397 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SSX1Q16384 188 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 UGT8Q16880 541 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PP6455Q8WZ26 134 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 COX14Q96I36 57 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PRSS37A4D1T9 235 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 NOTOA8MTQ0 251 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 F5H5P2 479 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 BET1O15155 118 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SEMA7AO75326 666 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 ATP6V1G1O75348 118 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 AADACP22760 399 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 HOXA6P31267 233 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 MTNR1BP49286 362 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 DSCR9P59020 149 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 LTC4SQ16873 150 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 NADK2Q4G0N4 442 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 XKR7Q5GH72 579 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 LGI3Q8N145 548 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 EP400Q96L91 3159 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 A0A1W2PR48 441 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SLC35F4A4IF30 521 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 ALG1L2C9J202 215 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 NDUFA2O43678 99 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 ORM1P02763 201 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 T-ENOLP0DO92 83 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 PAFAH1B2P68402 229 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SELPLGQ14242 412 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 MDGA2Q7Z553 956 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 MOB3BQ86TA1 216 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 R4GMQ9 66 aa6.63□□□□□ -1.35
EPHA3-201ENST00000336596 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms