RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 INPP5EQ9NRR6 644 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.63□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 CYTIPO60759 359 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HBE1P02100 147 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SBK2P0C263 348 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 COX7A1P24310 79 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 CLN3Q13286 438 aa9.62□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 ETV1P50549 477 aa9.62□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 COL19A1Q14993 1142 aa9.62□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 RTP4Q96DX8 246 aa9.62□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ASB16Q96NS5 453 aa9.62□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ASIC5Q9NY37 505 aa9.62□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SELEP16581 610 aa9.62□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 ORAI1Q96D31 301 aa9.62□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.61□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 KCNAB3O43448 404 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 BTNL8Q6UX41 500 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PKMYT1Q99640 499 aa9.61□□□□□ -0.87
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