RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 V9GY05 133 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNA1CQ13936 2221 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM30A4D0T7 59 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 MEGF11A6BM72 1044 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR14I1A6ND48 311 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 AHRRA9YTQ3 701 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PIN1P1O15428 100 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TALDO1P37837 337 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKXP51817 358 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 UCNP55089 124 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H3AP68431 136 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 GALK2Q01415 458 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 NABP1Q96AH0 204 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SP140LQ9H930 580 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GVI7 797 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ISPDA4D126 451 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ANXA2P2A6NMY6 339 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM25AB3EWG3 89 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM25CB3EWG5 89 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM25GB3EWG6 89 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 K7ENP7 123 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SGCEO43556 437 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT7O43581 403 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.993e-28■□□□□ 10.7
RABGGTB-201ENST00000319942 RANBP1P43487 201 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 EVX1P49640 407 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TPTEP56180 551 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 C3AR1Q16581 482 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP78Q5JTW2 689 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 XKRXQ6PP77 449 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB5Q8WWX0 329 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC32Q9BV29 185 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM206AQ9NX38 181 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 IFITM5A6NNB3 132 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 F5H5K5 113 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 AIPO00170 330 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TGM6O95932 706 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 B4GALT1P15291 398 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEB1P43366 347 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CX3CR1P49238 355 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10A3P58181 314 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB35Q15286 201 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC36A2Q495M3 483 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2A2Q6IF42 318 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SIAH3Q8IW03 269 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms