RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 CRB3Q9BUF7 120 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 FREM3P0C091 2139 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 RP1P56715 2156 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A1W2PPC1 479 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 CRYBA1P05813 215 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 PRKXP51817 358 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 MPPED2Q15777 294 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 MVB12AQ96EY5 273 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 C4orf45Q96LM5 186 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 HRH4Q9H3N8 390 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 FANCFQ9NPI8 374 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 AGTR1P30556 359 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 IL13RA1P78552 427 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ELP5Q8TE02 316 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 IFT22Q9H7X7 185 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A1B0GW55 424 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SULT2B1O00204 365 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF735P0CB33 412 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 PI3P19957 117 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC6A8P48029 635 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC16A13Q7RTY0 426 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 INTS14Q96SY0 518 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DUX4Q9UBX2 424 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM212A6NML5 194 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 TSPAN2O60636 221 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ADAM8P78325 824 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 EMC4Q5J8M3 183 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SVBPQ8N300 66 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 MRI1Q9BV20 369 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 COA4Q9NYJ1 87 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC17A2O00624 439 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 RENP00797 406 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCD3P28288 659 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 HTR2CP28335 458 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 PMPCAQ10713 525 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 NANPQ8TBE9 248 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 RXFP4Q8TDU9 374 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 PIGMQ9H3S5 423 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 C1orf198Q9H425 327 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 CTSFQ9UBX1 484 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DHDHQ9UQ10 334 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DMDP11532 3685 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 BGLAPP02818 100 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 PNLIPRP2P54317 469 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DCAF7P61962 342 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM225Q6GV28 225 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 D2HGDHQ8N465 521 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DCUN1D4Q92564 292 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 UPB1Q9UBR1 384 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 COPS7AQ9UBW8 275 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 NDRG3Q9UGV2 375 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.91■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ALG1L2C9J202 215 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF208O43345 1280 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DUX1O43812 170 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 BCKDHBP21953 392 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ACTBP60709 375 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ACTG1P63261 375 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 TGIF1Q15583 401 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC25A45Q8N413 288 aa15.9■□□□□ 0.14
TSPAN17-201ENST00000298564 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms