RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 APOC1P02654 83 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 H2BFMP0C1H6 154 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 DANCRP0C864 163 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TUBG1P23258 451 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 DCTDP32321 178 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TTKP33981 857 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 THBS4P35443 961 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF85Q03923 595 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ADIPOQQ15848 244 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL22Q53GT1 634 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SPATC1Q76KD6 591 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SSX6Q7RTT6 188 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 KRT77Q7Z794 578 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 OR52I1Q8NGK6 324 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 COG8Q96MW5 612 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 DOK1Q99704 481 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 JAM3Q9BX67 310 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MROQ9BYG7 248 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LRP12Q9Y561 859 aa11.4□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ITPR2Q14571 2701 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 VSTM5A8MXK1 200 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 H3BSA7 217 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PIPP12273 146 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 HSD11B1P28845 292 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PRKXP51817 358 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1CBP62140 327 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CSNK2BP67870 215 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 EFNB3Q15768 340 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MSMPQ1L6U9 139 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 VHLLQ6RSH7 139 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 DTX2Q86UW9 622 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ABHD4Q8TB40 342 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 IGFBPL1Q8WX77 278 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TBX5Q99593 518 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 OR51B6Q9H340 312 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 Q9H521 79 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 XPNPEP2O43895 674 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SULT1C4O75897 302 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LCKP06239 509 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF250P15622 560 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 DCKP27707 260 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SLC6A9P48067 706 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CX3CR1P49238 355 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FABP6P51161 128 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ERVS71-1P61550 626 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CDONQ4KMG0 1287 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 NAA40Q86UY6 237 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MUC15Q8N387 334 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF283Q8N7M2 679 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 GGHQ92820 318 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LURAP1Q96LR2 239 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CNBD2Q96M20 576 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF649Q9BS31 505 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 RHNO1Q9BSD3 238 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TTTY10Q9BZA0 68 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 IKZF2Q9UKS7 526 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CMAHPQ9Y471 501 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 POLQO75417 2590 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 USF3Q68DE3 2245 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 DAPL1A0PJW8 107 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PSMD9O00233 223 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SLC1A7O00341 560 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FAM20BO75063 409 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LCATP04180 440 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 KRT8P05787 483 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms