RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269318.9

CCDC40-201, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCDC40, Length 1,970 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-201ENST00000269318 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 FGGYQ96C11 551 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 MED13Q9UHV7 2174 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 OR5H15A6NDH6 313 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 ORC5O43913 435 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 SLC2A1P11166 492 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 GDNFP39905 211 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 MAGEA5P43359 124 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 ZNF84P51523 738 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 CLDN18P56856 261 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 SOX8P57073 446 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 TAS2R20P59543 309 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 SPOCK1Q08629 439 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 BIVMQ86UB2 503 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC40-201ENST00000269318 ARGFXA6NJG6 315 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 FAM166BA8MTA8 275 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 XRCC3O43542 346 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CTAG2O75638 210 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 HTR2CP28335 458 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 FAM27BQ5VT28 67 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ZNF529Q6P280 563 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 AAED1Q7RTV5 226 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OR52I2Q8NH67 350 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 KCNK15Q9H427 330 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CCL1P22362 96 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 DYRK1AQ13627 763 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 TATDN3Q17R31 274 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 LUZP2Q86TE4 346 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 LRRC18Q8N456 261 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ABHD3Q8WU67 409 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 A0A1B0GVI7 797 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CIB4A0PJX0 185 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 HMX3A6NHT5 357 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CCNKO75909 580 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ZNF708P17019 499 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 FBXO17Q96EF6 278 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SOX7Q9BT81 388 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CRLF2Q9HC73 371 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GGT3PA6NGU5 568 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 A6NL46 340 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 CENPXA8MT69 81 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 E9PLN8 166 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 LDLRAD4O15165 306 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 KRT33AO76009 404 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 IGLV3-1P01715 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 LIPCP11150 499 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 PTHLHP12272 177 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 HLA-DMAP28067 261 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 MEOX1P50221 254 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 GALK2Q01415 458 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-201ENST00000269318 FAM57BQ71RH2 274 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms