RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 DUX4Q9UBX2 424 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 FRYQ5TBA9 3013 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PPC1 479 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF878C9JN71 531 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 BGLAPP02818 100 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ITGA3P26006 1051 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CD38P28907 300 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 FAM57BQ71RH2 274 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 WDFY1Q8IWB7 410 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 OR4K15Q8NH41 348 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 GPX8Q8TED1 209 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 PHB2Q99623 299 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 FGF21Q9NSA1 209 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 EMC3Q9P0I2 261 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHB10Q9UN67 800 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 EML5Q05BV3 1969 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CLRN1P58418 232 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 BRICD5Q6PL45 260 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 GKN2Q86XP6 184 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 EXD3Q8N9H8 876 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 BHLHE23Q8NDY6 225 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 MRI1Q9BV20 369 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 WWTR1Q9GZV5 400 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 LAT2Q9GZY6 243 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.98□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 RER1O15258 196 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 BDKRB2P30411 391 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 MFAP5Q13361 173 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM104Q8NE00 496 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 SVILO95425 2214 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PPC4 97 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 MPTX1A8MV57 137 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 PLPP3O14495 311 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 SOCS1O15524 211 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 SPINK2P20155 84 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CRABP1P29762 137 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CSF2RBP32927 897 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 CEBPGP53567 150 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 SGCBQ16585 318 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 LY6G6FQ5SQ64 297 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 C11orf40Q8WZ69 217 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 LRFN5Q96NI6 719 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 S100A13Q99584 98 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 DDAH2O95865 285 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 SERPINA2P20848 420 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 EFNA3P52797 238 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF273Q14593 569 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 PDCD1Q15116 288 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF721Q8TF20 911 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 FAM221AA4D161 298 aa11.96□□□□□ -0.49
TMOD1-201ENST00000259365 C2CD4DB7Z1M9 353 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms