RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF69	Q9UC07	566 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	MIOX	Q9UGB7	285 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		12.37	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599		A8MXK9	166 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM178B	H3BS89	294 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	CDC42EP2	O14613	210 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC22	O60826	627 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	FSHB	P01225	129 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SCG5	P05408	212 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	CPT2	P23786	658 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	RAD23A	P54725	363 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2T2	Q6IF00	324 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZR03	302 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	GJC3	Q8NFK1	279 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	OR8G5	Q8NG78	346 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC7A6	Q92536	515 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	OR8B2	Q96RD0	313 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF747	Q9BV97	191 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		12.36	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	FFAR1	O14842	300 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	RER1	O15258	196 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	REN	P00797	406 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	HLA-DQA2	P01906	255 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	NOS3	P29474	1203 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	NUDT2	P50583	147 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	IL13RA1	P78552	427 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	MALL	Q13021	153 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM122B	Q7Z309	247 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	PARP8	Q8N3A8	854 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	GCM1	Q9NP62	436 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	UNC119B	A6NIH7	251 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF205	O95201	554 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	DBH	P09172	617 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	COX4I1	P13073	169 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC36A3	Q495N2	470 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	OTP	Q5XKR4	325 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	KLB	Q86Z14	1044 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	FANK1	Q8TC84	345 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	COQ7	Q99807	217 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	NUAK2	Q9H093	628 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM100	Q9NV29	134 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PRQ8	180 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	TMPRSS2	O15393	492 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	WIPF1	O43516	503 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	GPANK1	O95872	356 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	CRYBA1	P05813	215 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	NCK1	P16333	377 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	RHCE	P18577	417 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	FUT4	P22083	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	FPR3	P25089	353 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC6A6	P31641	620 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	PITPNB	P48739	271 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	GSK3B	P49841	420 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	ERF	P50548	548 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	SMIM11A	P58511	58 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	FHL1	Q13642	323 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	DGCR6	Q14129	220 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	LEG1	Q6P5S2	330 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		12.33	□□□□□ -0.44

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