RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 COX5AP20674 150 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 UGT2B10P36537 528 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 VBP1P61758 197 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 LSM3P62310 102 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 FABP5Q01469 135 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf135Q5VTT2 229 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 USP43Q70EL4 1123 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 RPRMLQ8N4K4 120 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPOQ9BU64 300 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PTTG2Q9NZH5 202 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXL3Q9UKT7 428 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC5A6Q9Y289 635 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ACOD1A6NK06 481 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRPO00591 440 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFPL1O95159 310 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OPRM1P35372 400 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 NCS1P62166 190 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM211Q6ICI0 200 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PAMR1Q6UXH9 720 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 NAXEQ8NCW5 288 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PHYHIPQ92561 330 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 THRSPQ92748 146 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2H1Q9GZK4 316 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TINAGQ9UJW2 476 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SC5DO75845 299 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 UBL3O95164 117 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PNPP00491 289 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-2P23083 117 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ARR3P36575 388 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBA1BP68363 451 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 NFATC3Q12968 1075 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY6Q15077 328 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR38Q5JTN6 314 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBA1AQ71U36 451 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRG1Q8N1C3 465 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS35Q8N3Z0 413 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ABHD4Q8TB40 342 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SPTSSAQ969W0 71 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT8Q9NY28 637 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF224Q9NZL3 707 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 E9PLN8 166 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNGR3O43761 229 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 DOK2O60496 412 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 GATBO75879 557 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG4Q00888 419 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 C3P1Q6ZMU1 363 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IL17RDQ8NFM7 739 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD7Q96MP8 289 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 VKORC1Q9BQB6 163 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 HDHD5Q9BXW7 423 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGMQ9H3S5 423 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM206AQ9NX38 181 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52A1Q9UKL2 312 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6C6A6NF89 314 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 COX5BP10606 129 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 SPCS2Q15005 226 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM53Q6P2H8 277 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF676Q8N7Q3 588 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1F12Q8NHA8 337 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF121Q9H920 327 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 G6PC2Q9NQR9 355 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A096LPE4 126 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPZ6 126 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRTM2O43300 516 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR3DL2P43630 455 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 PMPCAQ10713 525 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM91Q6ZNR0 172 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF610Q8N9Z0 462 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT5BQ9H1J7 359 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ATRXP46100 2492 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ISG15P05161 165 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 TBRG1Q3YBR2 411 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL2L15Q5TBC7 163 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF283Q8N7M2 679 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 DCSTAMPQ9H295 470 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPW3 197 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 CIB4A0PJX0 185 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 MSTNO14793 375 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYGSP22914 178 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 CX3CR1P49238 355 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRA6Q16445 453 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 ACSM3Q53FZ2 586 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-206ENST00000588815 C22orf42Q6IC83 251 aa27.11■■□□□ 1.93
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