RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	GALK2	Q01415	458 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	OTOS	Q8NHW6	89 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	C4orf45	Q96LM5	186 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	TEAD3	Q99594	435 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	DOK1	Q99704	481 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ABHD6	Q9BV23	337 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	C8orf4	Q9NR00	106 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	C5orf63	A6NC05	138 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538		B9A039	149 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ZNF878	C9JN71	531 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538		H3BSA7	217 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538		J3QW42	95 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SLC16A6	O15403	523 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	NDUFS7	O75251	213 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ABHD16A	O95870	558 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	IGHV4-39	P01824	125 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CCNO	P22674	350 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SERPINF1	P36955	418 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	OPRL1	P41146	370 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	EVX1	P49640	407 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	PPOX	P50336	477 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CDC42	P60953	191 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	PPP1CB	P62140	327 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ABHD4	Q8TB40	342 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538		M0R135	149 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CLPTM1	O96005	669 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ALOX5AP	P20292	161 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	HTR1F	P30939	366 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	RGS6	P49758	472 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ART1	P52961	327 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SLC34A1	Q06495	639 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ECH1	Q13011	328 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	OCLN	Q16625	522 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SHF	Q7M4L6	423 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	PERP	Q96FX8	193 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	EDAR	Q9UNE0	448 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	STARD10	Q9Y365	291 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP22-211	ENST00000584538	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		10.15	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms