RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558040.5

SNX1-203, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-203ENST00000558040 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 R4GMQ9 66 aa14.73□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 OR6C6A6NF89 314 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 OR5H1A6NKK0 313 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 E9PI62 339 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 CELP19835 753 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 LIPAP38571 399 aa14.72□□□□□ -0.05
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SNX1-203ENST00000558040 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 DOC2BQ14184 412 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 CDK5R1Q15078 307 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 TSC22D1Q15714 1073 aa14.72□□□□□ -0.05
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SNX1-203ENST00000558040 PHC2Q8IXK0 858 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 LRRC46Q96FV0 321 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.72□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.72□□□□□ -0.05
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SNX1-203ENST00000558040 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 OGG1O15527 345 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 PLPP2O43688 288 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 CD1AP06126 327 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 CD36P16671 472 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 CD53P19397 219 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 UQCRFS1P47985 274 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 MMP16P51512 607 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 TPTEP56180 551 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 TUBA1BP68363 451 aa14.71□□□□□ -0.05
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SNX1-203ENST00000558040 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.71□□□□□ -0.05
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SNX1-203ENST00000558040 ARL9Q6T311 187 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 TUBA1AQ71U36 451 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 MDP1Q86V88 176 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 SMIM19Q96E16 107 aa14.71□□□□□ -0.05
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SNX1-203ENST00000558040 OR10A4Q9H209 315 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX1-203ENST00000558040 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.71□□□□□ -0.05
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SNX1-203ENST00000558040 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.71□□□□□ -0.05
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SNX1-203ENST00000558040 DPPA5A6NC42 116 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 ACOD1A6NK06 481 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 F5H5K5 113 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 C16orf97H3BN30 126 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 M0R135 149 aa14.7□□□□□ -0.06
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SNX1-203ENST00000558040 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 GABRA5P31644 462 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CX3CR1P49238 355 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CCR9P51686 369 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 PRKXP51817 358 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 TRAM1Q15629 374 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SSX1Q16384 188 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SSX8Q7RTT4 187 aa14.7□□□□□ -0.06
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SNX1-203ENST00000558040 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 ZNF799Q96GE5 643 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 C4orf45Q96LM5 186 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 DOK1Q99704 481 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SP140LQ9H930 580 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 NOX3Q9HBY0 568 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 TMEM212A6NML5 194 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 GPRIN2O60269 458 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 C1QL1O75973 258 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CBR1P16152 277 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CRYGSP22914 178 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 APLNRP35414 380 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 UGT2B10P36537 528 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 TGFBR2P37173 567 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SLC6A9P48067 706 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SLC3A1Q07837 685 aa14.69□□□□□ -0.06
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