RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 REEP1Q9H902 201 aa15.64■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.64■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ATRQ13535 2644 aa15.64■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR6C68A6NDL8 312 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 GASTP01350 101 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ADH4P08319 380 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PCMT1P22061 227 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 SRP14P37108 136 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 RGS6P49758 472 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 COX10Q12887 443 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR2T5Q6IEZ7 315 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR5L1Q8NGL2 311 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR2T29Q8NH02 315 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 RAB1CQ92928 201 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 VNN3Q9NY84 501 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 U3KQV3 271 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 CUBNO60494 3623 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 J3QW42 95 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 CD55P08174 381 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 KITLGP21583 273 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TNFSF4P23510 183 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 LMO4P61968 165 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 HIST1H3AP68431 136 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 SLC3A1Q07837 685 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 CYB561A3Q8NBI2 242 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR51F2Q8NH61 342 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PTP4A1Q93096 173 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM186Q96B77 213 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 RAB39BQ96DA2 213 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ASB9Q96DX5 294 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PITX2Q99697 317 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 THTPAQ9BU02 230 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 DNHD1Q96M86 4753 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ISPDA4D126 451 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 BHLHE40O14503 412 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 MSMBP08118 114 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PYCR1P32322 319 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ERFP50548 548 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 CDK5R2Q13319 367 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 MICAQ29983 383 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 SPRNQ5BIV9 151 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR5AS1Q8N127 324 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR2Z1Q8NG97 314 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 HAVCR1Q96D42 359 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 C1orf21Q9H246 121 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 IL20Q9NYY1 176 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 UBOX5O94941 541 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 SOX14O95416 240 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 RAP2AP10114 183 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 RAC2P15153 192 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF823P16415 610 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR2T4Q8NH00 348 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM158Q8WZ71 300 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 GAL3ST1Q99999 423 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TVP23AA6NH52 213 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 F5H5K5 113 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ANPEPP15144 967 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TNFRSF1AP19438 455 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ECH1Q13011 328 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR2T2Q6IF00 324 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 Q6ZR03 302 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 SLC37A3Q8NCC5 494 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 ATF6BQ99941 703 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD1-208ENST00000555806 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms