RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHFQ7M4L6 423 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GID4Q8IVV7 300 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR8J1Q8NGP2 316 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABHD4Q8TB40 342 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ST7LQ8TDW4 575 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IL4I1Q96RQ9 567 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MBOAT4Q96T53 435 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR51B6Q9H340 312 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.09□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC182A6NF36 153 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SELENOFO60613 162 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DBHP09172 617 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF250P15622 560 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TUBG1P23258 451 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PEX2P28328 305 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDKN1AP38936 164 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RGS6P49758 472 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPOXP50336 477 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GGTLC2Q14390 218 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TESK1Q15569 626 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MSMPQ1L6U9 139 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC7A6Q92536 515 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COG8Q96MW5 612 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TEAD3Q99594 435 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.08□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM129A0AVI4 362 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF878C9JN71 531 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NUDT6P53370 316 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP5J2P56134 94 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SELENOVP59797 346 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERVS71-1P61550 626 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPP1CBP62140 327 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LPCAT4Q643R3 524 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OTOSQ8NHW6 89 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RFKQ969G6 155 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPTSSAQ969W0 71 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PERPQ96FX8 193 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DOK1Q99704 481 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYT3Q9BQG1 590 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COPS4Q9BT78 406 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABHD6Q9BV23 337 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GMPPBQ9Y5P6 360 aa11.07□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIVEP1P15822 2718 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 F5H5K5 113 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H0YHG0 523 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 M0R135 149 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC16A6O15403 523 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NGFP01138 241 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LYNP07948 512 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ACSM4P0C7M7 580 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GCH1P30793 250 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HTR1FP30939 366 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC15A1P46059 708 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TPTEP56180 551 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC34A1Q06495 639 aa11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms