RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523298.5

CTNNA1-238, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 2

Gene CTNNA1, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-238	ENST00000523298	TGM7	Q96PF1	710 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	COPS4	Q9BT78	406 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	RSG1	Q9BU20	258 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	DUSP16	Q9BY84	665 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	GID8	Q9NWU2	228 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	USE1	Q9NZ43	259 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ATP10D	Q9P241	1426 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	GHRL	Q9UBU3	117 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ATP7B	P35670	1465 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ALS2	Q96Q42	1657 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ATRX	P46100	2492 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298		A0A1B0GVY2	172 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298		A0A1W2PNV4	684 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298		A0A1W2PPE3	182 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	BTN3A3	O00478	584 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	GOSR2	O14653	212 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ZBTB5	O15062	677 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SLC31A2	O15432	143 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	XRCC2	O43543	280 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	DPM1	O60762	260 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	HUS1	O60921	280 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PFDN1	O60925	122 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	MED6	O75586	246 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SLC2A10	O95528	541 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	IFNA5	P01569	189 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	FGG	P02679	453 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	GSTA1	P08263	222 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	LINC00614	P0C842	121 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	CALCR	P30988	508 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	KDELR2	P33947	212 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SHMT2	P34897	504 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	MPI	P34949	423 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	MAP3K8	P41279	467 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	NAPA	P54920	295 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	TMEM33	P57088	247 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PLP1	P60201	277 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ERVK-8	P63133	956 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PSPH	P78330	225 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	CCL7	P80098	99 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	RAD51	Q06609	339 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	DPYSL3	Q14195	570 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	ARL6IP1	Q15041	203 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	RAB35	Q15286	201 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	UBE2V2	Q15819	145 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	TRIM16L	Q309B1	348 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	HACD4	Q5VWC8	232 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	UQCC3	Q6UW78	93 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SYS1	Q8N2H4	156 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	STK40	Q8N2I9	435 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SYT14	Q8NB59	555 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	NANP	Q8TBE9	248 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	TMEM239	Q8WW34	195 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	S100PBP	Q96BU1	408 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	PSMB7	Q99436	277 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CTNNA1-238	ENST00000523298	TSC22D3	Q99576	134 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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