RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 TM4SF18Q96CE8 201 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GPR137Q96N19 417 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ARHGDIGQ99819 225 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF649Q9BS31 505 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PINK1Q9BXM7 581 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR51B5Q9H339 312 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LHX9Q9NQ69 397 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 AHSPQ9NZD4 102 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 EMC3Q9P0I2 261 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CD84Q9UIB8 345 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LIPT1Q9Y234 373 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MICAL3Q7RTP6 2002 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ALPK3Q96L96 1907 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 COL4A2P08572 1712 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A0A0A6YYD5 115 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR2AG2A6NM03 316 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 A8MX80 341 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 J3QRE1 110 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PRRG1O14668 218 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CHP2O43745 196 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR2B3O76000 313 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LALBAP00709 142 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HLA-DPB1P04440 258 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ATP1B1P05026 303 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 KLK1P06870 262 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CTSLP07711 333 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 DANCRP0C864 163 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR12D1P0DN82 309 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 POU2F1P14859 743 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GABRR2P28476 465 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 PPP2R1BP30154 601 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HTR1FP30939 366 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 BTCP35070 178 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HSD17B2P37059 387 aa3.56□□□□□ -1.84
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SGCE-211ENST00000522045 OMPP47874 163 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 OR3A3P47888 321 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 MAPK12P53778 367 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RAG2P55895 527 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GNA13Q14344 377 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GINS1Q14691 196 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TRAM2Q15035 370 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF146Q15072 292 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IGSF11Q5DX21 431 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LRRC73Q5JTD7 316 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMEM220Q6QAJ8 160 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 WASH2PQ6VEQ5 465 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NUP54Q7Z3B4 507 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ASPGQ86U10 573 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 IQCHQ86VS3 1027 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GID4Q8IVV7 300 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 CMTM8Q8IZV2 173 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 Q8N402 240 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SUN5Q8TC36 379 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 RAET1EQ8TD07 263 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 NSMAFQ92636 917 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 HYLS1Q96M11 299 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 ZNF558Q96NG5 402 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 SLC38A2Q96QD8 506 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 GPA33Q99795 319 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-211ENST00000522045 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
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