RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF691	Q5VV52	312 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	C22orf42	Q6IC83	251 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	LUZP2	Q86TE4	346 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	PCP2	Q8IVA1	136 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ZFP90	Q8TF47	636 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	VCX	Q9H320	206 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	LRRC37A3	O60309	1634 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CLTCL1	P53675	1640 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	NSD2	O96028	1365 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	TECPR2	O15040	1411 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	PAPPA	Q13219	1627 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SIRPB1	O00241	398 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ANGPTL7	O43827	346 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	GABARAP	O95166	117 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	OMG	P23515	440 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CEACAM6	P40199	344 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CDKN2B	P42772	138 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CX3CR1	P49238	355 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	GINS1	Q14691	196 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	POU2AF1	Q16633	256 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	IQCK	Q8N0W5	287 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	STPG2	Q8N412	459 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	PRELID2	Q8N945	189 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284		Q8N976	141 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	OR4S2	Q8NH73	311 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF596	Q8TC21	504 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	TPK1	Q9H3S4	243 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	GCNT4	Q9P109	453 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	PSG11	Q9UQ72	335 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP7B	P35670	1465 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	PIK3C2A	O00443	1686 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	PPL	O60437	1756 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	KLHL41	O60662	606 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	DNAJB6	O75190	326 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	MYL2	P10916	166 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	DCK	P27707	260 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	MERTK	Q12866	999 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SELENBP1	Q13228	472 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	MAB21L1	Q13394	359 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CHRNA6	Q15825	494 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	STARD8	Q92502	1023 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	NOX3	Q9HBY0	568 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	TBX21	Q9UL17	535 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	NHS	Q6T4R5	1651 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	MYO10	Q9HD67	2058 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	SSH2	Q76I76	1423 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PTPRK-215	ENST00000498284	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		2.67	□□□□□ -1.98

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