RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-208	ENST00000493601	MMP16	P51512	607 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF154	Q13106	437 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	OTP	Q5XKR4	325 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	TXNDC12	O95881	172 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	DBH	P09172	617 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF12	P17014	697 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC6A9	P48067	706 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	COQ7	Q99807	217 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	IMPA2	O14732	288 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	GMNN	O75496	209 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	CPT2	P23786	658 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	CENPA	P49450	140 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	PSME3	P61289	254 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SEC23B	Q15437	767 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	AWAT1	Q58HT5	328 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	GPA33	Q99795	319 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SMIM11A	P58511	58 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	HIST1H3A	P68431	136 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	COX10	Q12887	443 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	MEP1B	Q16820	701 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	GLYAT	Q6IB77	296 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	DOK3	Q7L591	496 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRU-208	ENST00000493601	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	DIRAS1	O95057	198 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	GPANK1	O95872	356 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	REN	P00797	406 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	SELE	P16581	610 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC6A6	P31641	620 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PTPRU-208	ENST00000493601	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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