RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 RAB32Q13637 225 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF235Q14590 738 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CDK5R1Q15078 307 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TAF13Q15543 124 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ACTBL2Q562R1 376 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF787Q6DD87 383 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NIPAL3Q6P499 406 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OPN5Q6U736 354 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 APCDD1Q8J025 514 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KDM8Q8N371 416 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NUBPLQ8TB37 319 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 WDR92Q96MX6 357 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR2M4Q96R27 311 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A12Q96S37 553 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRRT1Q99946 306 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SEMA3CQ99985 751 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR51I1Q9H343 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ASB8Q9H765 288 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KLK11Q9UBX7 282 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NINQ8N4C6 2090 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MYO7AQ13402 2215 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 A0A087WZY1 265 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LINC01553A4QN01 128 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FAM183AA6NL82 134 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FAM229AH3BQW9 127 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 F2RL2O00254 374 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 YY2O15391 372 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LRATO95237 230 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PMP2P02689 132 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 F13BP05160 661 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FURINP09958 794 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR2T7P0C7T2 308 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF1BP20333 461 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC2A5P22732 501 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB25P24278 435 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LMO1P25800 156 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PCSK1P29120 753 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DCTDP32321 178 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRSS3P35030 304 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GPR4P46093 362 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PDLIM4P50479 330 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF84P51523 738 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RND2P52198 227 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 AKR1C2P52895 323 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PSG6Q00889 435 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 AKR1C1Q04828 323 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DHRS2Q13268 280 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PHF19Q5T6S3 580 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LEMD1Q68G75 181 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms