RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 USP27XA6NNY8 438 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 WRBO00258 174 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 DYNC1I1O14576 645 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZBTB5O15062 677 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 EEDO75530 441 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGLV1-47P01700 117 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF19P17023 458 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC2A5P22732 501 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 RRM2P31350 389 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 BTCP35070 178 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 SSR4P51571 173 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 UGT2B15P54855 530 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 C21orf59P57076 290 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 SP4Q02446 784 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF92Q03936 586 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 CHRNA6Q15825 494 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 LY6G6FQ5SQ64 297 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 C9orf135Q5VTT2 229 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM220Q6QAJ8 160 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 C6orf89Q6UWU4 347 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 CERS6Q6ZMG9 384 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM135Q86UB9 458 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 SUMF2Q8NBJ7 301 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 FBXL13Q8NEE6 735 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM81AQ8TBF8 368 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 NRGNQ92686 78 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM54Q969K7 222 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 ATP5SQ99766 215 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 RARRES2Q99969 163 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 C11orf70Q9BRQ4 267 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 C20orf24Q9BUV8 137 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 CWH43Q9H720 699 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 AUNIPQ9H7T9 357 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 RGS18Q9NS28 235 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 GCNT4Q9P109 453 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 GNPTGQ9UJJ9 305 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 GINS2Q9Y248 185 aa2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
ITGB3BP-211ENST00000478538 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa2.78□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIAA1671Q9BY89 1806 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPEGQ15772 3267 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 A0A0G2JN53 185 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF726A6NNF4 738 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 H0YIV9 168 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LSM1O15116 133 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC31A2O15432 143 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CLPXO76031 633 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ACTL6AO96019 429 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 MOSP00540 346 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 FGGP02679 453 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ALDOBP05062 364 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 GKN3PP0CG01 181 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR8G3PP0DMU2 310 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TDGF1P13385 188 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF24P17028 368 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ELK1P19419 428 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CTRLP40313 264 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMED10P49755 219 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAB9AP51151 201 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TDGF1P3P51864 188 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 MERTKQ12866 999 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 PSG7Q13046 419 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRC10Q5BKY1 277 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 PAGE3Q5JUK9 113 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CNIH2Q6PI25 160 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ACP7Q6ZNF0 438 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 COX15Q7KZN9 410 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 EID2Q8N6I1 236 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 NPBQ8NG41 125 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR10G9Q8NGN4 311 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR1N2Q8NGR9 330 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 RHEBL1Q8TAI7 183 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 STARD8Q92502 1023 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC126Q96EE4 140 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 RASL11BQ9BPW5 248 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANP32EQ9BTT0 268 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR51M1Q9H341 326 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 UGT1A7Q9HAW7 530 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 UGT1A10Q9HAW8 530 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms