RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902		F5H5K5	113 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	NAT2	P11245	290 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	GSTT1	P30711	240 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ENTPD1	P49961	510 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	C18orf12	Q96KH6	178 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CIB1	Q99828	191 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ATF6B	Q99941	703 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		15.22	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	GLCE	O94923	617 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MT-ND5	P03915	603 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MPV17	P39210	176 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	DSCR9	P59020	149 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ECH1	Q13011	328 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	TAF13	Q15543	124 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MOG	Q16653	247 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	FAM168A	Q92567	244 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	STMN2	Q93045	179 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MAP6	Q96JE9	813 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	INTS14	Q96SY0	518 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	S100A14	Q9HCY8	104 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CENPM	Q9NSP4	180 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	STARD10	Q9Y365	291 aa		15.21	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PLSCR5	A0PG75	271 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	RNF223	E7ERA6	249 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	BAG2	O95816	211 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	INHBB	P09529	407 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	EPHA2	P29317	976 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	RGS6	P49758	472 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SPATC1	Q76KD6	591 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	COG8	Q96MW5	612 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	15.2	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ICMT	O60725	284 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-13	P01766	116 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	CSF3	P09919	207 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PSKH1	P11801	424 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	DAO	P14920	347 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SLC6A9	P48067	706 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PDLIM4	P50479	330 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TPTE	P56180	551 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	APOF	Q13790	326 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	BIVM	Q86UB2	503 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SPTSSA	Q969W0	71 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	COPS4	Q9BT78	406 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	REG4	Q9BYZ8	158 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	POFUT1	Q9H488	388 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	CR1	P17927	2039 aa		15.19	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZAN	Q9Y493	2812 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZAR1L	A6NP61	321 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902		M0R129	80 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PRODH	O43272	600 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PRKY	O43930	277 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	LCAT	P04180	440 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R2B	Q00005	443 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN26	Q16670	478 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TEX30	Q5JUR7	227 aa		15.18	■□□□□ 0.02

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