RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 BTBD17A6NE02 478 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 F5H5P2 479 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 LIPFP07098 398 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 AGKQ53H12 422 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 Q6ZSV7 163 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 IGFN1Q86VF2 1251 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OR8G5Q8NG78 346 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OR11L1Q8NGX0 322 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 MRAPQ8TCY5 172 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 TMEM239Q8WW34 195 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 POLE4Q9NR33 117 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.83□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 TMEM120BA0PK00 339 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 A6NIZ1 184 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 IGHV1-69P01742 117 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RAP1BP61224 184 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RAP1AP62834 184 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 EGR3Q06889 387 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 Q6ZTK2 550 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 REC114Q7Z4M0 266 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 WDFY2Q96P53 400 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 TBX15Q96SF7 602 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 PCDHAC1Q9H158 963 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 TMEM100Q9NV29 134 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RIMS3Q9UJD0 308 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 TMCC3Q9ULS5 477 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 GMEB1Q9Y692 573 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.82□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 A0A0U1RQK1 487 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 H7C1C5 153 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 HLA-DPB1P04440 258 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 SCG5P05408 212 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 PMELP40967 661 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 IER3P46695 156 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 NPY4RP50391 375 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 MTPNP58546 118 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ARF6P62330 175 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 LCN6P62502 163 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ZNF181Q2M3W8 571 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 EPGNQ6UW88 154 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 MICU2Q8IYU8 434 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 TAMM41Q96BW9 452 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RASD2Q96D21 266 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 WACQ9BTA9 647 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RERGLQ9H628 205 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.81□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 FBP2O00757 339 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 IFI30P13284 250 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 TNFRSF1BP20333 461 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 FPR3P25089 353 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RGS6P49758 472 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 LOXL3P58215 753 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 KCNJ8Q15842 424 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OTPQ5XKR4 325 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OR51A7Q8NH64 312 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 C10orf82Q8WW14 230 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 HCAR1Q9BXC0 346 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 WDR76Q9H967 626 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.8□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 XKRYO14609 159 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 MLNRO43193 412 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 ADAM20O43506 726 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OR5F1O95221 314 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 FSTL3O95633 263 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OPN1MWP04001 364 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 DBHP09172 617 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 MMP9P14780 707 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 SELPLGQ14242 412 aa11.79□□□□□ -0.52
CENPF-202ENST00000464322 OR8B8Q15620 311 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms