RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442201.6

CCDC39-201, Transcript of coiled-coil domain containing 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC39, Length 3,279 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-201ENST00000442201 GFRA1P56159 465 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 CLDN20P56880 219 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 H3F3AP84243 136 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 GGTLC2Q14390 218 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ASB10Q8WXI3 467 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 MED29Q9NX70 200 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 RASD1Q9Y272 281 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 A0A1W2PQ09 198 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 FAM74A7A6NL05 159 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SMLR1H3BR10 107 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 AIREO43918 545 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 VAMP5O95183 116 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF43P17038 809 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 RAC3P60763 192 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 HBMQ6B0K9 141 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 OR6V1Q8N148 313 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 STPG2Q8N412 459 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 BVESQ8NE79 360 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TBX5Q99593 518 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 NIT2Q9NQR4 276 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 DCTN6O00399 190 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 LALBAP00709 142 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 CELA3AP09093 270 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 LAP3P28838 519 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 CRABP1P29762 137 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 RGS6P49758 472 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 BIDP55957 195 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 CARD18P57730 90 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 COTL1Q14019 142 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 VASNQ6EMK4 673 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 GGNQ86UU5 652 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 OR8H2Q8N162 312 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TM9SF4Q92544 642 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 EMC7Q9NPA0 242 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 A6NJY4 79 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 AIPO00170 330 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SLC16A7O60669 478 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 RAMP1O60894 148 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SLC43A1O75387 559 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SCG5P05408 212 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 OR2T7P0C7T2 308 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TNFSF8P32971 234 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SLC10A1Q14973 349 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 THEM4Q5T1C6 240 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF511Q8NB15 262 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SYT14Q8NB59 555 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 OR2T27Q8NH04 317 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF649Q9BS31 505 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 EMC6Q9BV81 110 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ALG8Q9BVK2 526 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TREM2Q9NZC2 230 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 B9D1Q9UPM9 204 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SULT1C2O00338 296 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 CXCL13O43927 109 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 PLATP00750 562 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 TFP02787 698 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 KLK2P20151 261 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SLC3A1Q07837 685 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 OR10D3Q8NH80 312 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 UCN2Q96RP3 112 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 KCNK17Q96T54 332 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC39-201ENST00000442201 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms