RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 C11orf87Q6NUJ2 197 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 OR13C8Q8NGS7 320 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 GPX8Q8TED1 209 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PPC1 479 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 HOXB5P09067 269 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CNR1P21554 472 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 RORAP35398 523 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINF1P36955 418 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC25A1P53007 311 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 GLO1Q04760 184 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ARFRP1Q13795 201 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 OVCH2Q7RTZ1 564 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRC75AQ8NAA5 344 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 MCHR2Q969V1 340 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 NUDT9Q9BW91 350 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 OR6C76A6NM76 312 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXO24O75426 580 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PDSS1Q5T2R2 415 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 OR10H5Q8NGA6 315 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CMTM3Q96MX0 182 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 MPTX1A8MV57 137 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ABOP16442 354 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 GABRG2P18507 467 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ELOCQ15369 112 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 LCN10Q6JVE6 187 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM17Q86X19 198 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 OR6K3Q8NGY3 331 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 METTL21EPA6NDL7 271 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF432O94892 652 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 MGMTP16455 207 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CDAP32320 146 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 EGR3Q06889 387 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 DMWDQ09019 674 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CCINQ13939 588 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 MANEAQ5SRI9 462 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 EXD3Q8N9H8 876 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 MRI1Q9BV20 369 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 SYT7O43581 403 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 TFAP2EQ6VUC0 442 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 RTL10Q7L3V2 364 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC26A10Q8NG04 563 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 SCGB1D2O95969 90 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 HCKP08631 526 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 UBBP0CG47 229 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 NFYBP25208 207 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 AGTR1P30556 359 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC37A1P57057 533 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 UBA52P62987 128 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PHB2Q99623 299 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 RPA2P15927 270 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 FZD2Q14332 565 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 C1orf140Q5VVS0 124 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF585AQ6P3V2 769 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CLRN3Q8NCR9 226 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 LRRC61Q9BV99 259 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 PDE7BQ9NP56 450 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CLDN16Q9Y5I7 305 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 CASRP41180 1078 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms