RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF404Q494X3 552 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MESTQ5EB52 335 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM156AQ8NDB6 213 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8G5Q8NG78 346 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8B3Q8NGG8 313 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPD52L3Q96J77 140 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHA8Q96JA3 519 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB18Q96M61 343 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF583Q96ND8 569 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF570Q96NI8 536 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8B2Q96RD0 313 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM246Q9BRR3 403 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIKE1Q9BRV8 207 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHCGQ9UBD6 479 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASH2LQ9UBL3 628 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JK05 382 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JND7 137 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS37A4D1T9 235 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM220BPB1ANY3 271 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRRM5B3KS81 715 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFAB1O14561 156 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKRYO14609 159 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLNRO43193 412 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AHCYL1O43865 530 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSTL3O95633 263 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KNG1P01042 644 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD14P08571 375 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDELR2P33947 212 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YAP1P46937 504 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS6P49758 472 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAM2Q15035 370 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF181Q2M3W8 571 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COQ5Q5HYK3 327 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTPQ5XKR4 325 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T2Q6IF00 324 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXW12Q6X9E4 464 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C17orf107Q6ZR85 190 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM122BQ7Z309 247 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOGAT3Q86VF5 341 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10S1Q8NGN2 331 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1F12Q8NHA8 337 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C10orf82Q8WW14 230 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASD2Q96D21 266 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q96M85 177 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATPIF1Q9UII2 106 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC30A6NM36 301 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0YL77 283 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3KTA2 159 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC42EP2O14613 210 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRASO14807 208 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM107AO95990 144 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBHP09172 617 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR4P46093 362 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PITPNBP48739 271 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAG2P55895 527 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSM6P62312 80 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELENOWP63302 87 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL21CQ5VZV1 264 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf87Q8N0U7 546 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FITM2Q8N6M3 262 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5L1Q8NGL2 311 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4F5Q8NH21 305 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FNDC11Q9BVV2 318 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEX1Q9HBH7 125 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLN8Q9UBY8 286 aa10.99□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WUU8 490 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBIP1A8MTZ0 92 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F5H5P2 479 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHYHO14832 338 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDF1O60869 148 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPPAP01160 153 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNW1P05000 195 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF12P61328 243 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM201AQ5SY85 155 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR157Q5UAW9 335 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF730Q6ZMV8 503 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms