RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 DPYSL2Q16555 572 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC80Q76M96 950 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 NKAIN4Q8IVV8 208 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 COX18Q8N8Q8 333 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR10T2Q8NGX3 314 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF75AQ96N20 296 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTC25Q96NG3 672 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 INIPQ9NRY2 104 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC7A8Q9UHI5 535 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 RWDD2AQ9UIY3 292 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 VANGL2Q9ULK5 521 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 CHMP2BQ9UQN3 213 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADGRB3O60242 1522 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 LEUTXA8MZ59 168 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 CHMLP26374 656 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 MPIP34949 423 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 GAMTQ14353 236 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 QPRTQ15274 297 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 KDM8Q8N371 416 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR4D5Q8NGN0 318 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 SH3GL1Q99961 368 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 MFFQ9GZY8 342 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 MEAF6Q9HAF1 191 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 TAS2R5Q9NYW4 299 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNE3Q9Y6H6 103 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU2-38P-201ENST00000410856 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 MPDZO75970 2070 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 COL7A1Q02388 2944 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLDN3O15551 220 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAMP3O60896 148 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCO1O75880 301 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERLIN2O94905 339 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNK2O95069 426 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPX1P07203 203 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 HSMCR30P0CW71 290 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 HTR2AP28223 471 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 MXD1Q05195 221 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 TWF1Q12792 350 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 FILIP1LQ4L180 1135 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 C16orf87Q6PH81 154 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF645Q8N7E2 425 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 OMDQ99983 421 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNJ16Q9NPI9 418 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 AURKCQ9UQB9 309 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC22A7Q9Y694 548 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A1B0GVL5 298 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 H3BQ85 93 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 L7N2F9 121 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRKAB2O43741 272 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 NRASP01111 189 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 HRASP01112 189 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRASP01116 189 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 NELFEP18615 380 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRPS1L1P21108 318 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCR1P32246 355 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 ILKQ13418 452 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 DGCR6Q14129 220 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 RCAN2Q14206 197 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF767PQ75MW2 155 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR10G6Q8NH81 332 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT35Q92764 455 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUDT9Q9BW91 350 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRRC19Q9H756 370 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF160Q9HCG1 818 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 SUN2Q9UH99 717 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 CRB1P82279 1406 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 NCAPD2Q15021 1401 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 A8MWL6 223 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 CENPBD1B2RD01 187 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 TIMM44O43615 452 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR7A10O76100 309 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGHV3-53P01767 116 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 FUT1P19526 365 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM104BQ5XKR9 115 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC38A6Q8IZM9 456 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 DESI2Q9BSY9 194 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU2-38P-201ENST00000410856 SAMD10Q9BYL1 202 aa-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms