RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF13Q15543 124 aa13.23□□□□□ -0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 C12orf73Q69YU5 71 aa13.23□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM154Q6P9G4 183 aa13.23□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP77Q6ZQR2 320 aa13.23□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 DCXRQ7Z4W1 244 aa13.23□□□□□ -0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 DPY19L4Q7Z388 723 aa13.21□□□□□ -0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 TEAD3Q99594 435 aa13.21□□□□□ -0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 CYSLTR2Q9NS75 346 aa13.21□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 CENPMQ9NSP4 180 aa13.21□□□□□ -0.29
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A31A6NKX4 558 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF878C9JN71 531 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-13P01766 116 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ADRA2AP08913 450 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 DBHP09172 617 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CSF3P09919 207 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ANPEPP15144 967 aa13.2□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 RPS27P42677 84 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVS71-1P61550 626 aa13.2□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 MSMPQ1L6U9 139 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC12BQ2HXU8 276 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.2□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 HRASLS5Q96KN8 279 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 IL4I1Q96RQ9 567 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2J1Q9GZK6 312 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 YIPF3Q9GZM5 350 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TOR3AQ9H497 397 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SP140LQ9H930 580 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TAAR3PQ9P1P4 343 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 STARD10Q9Y365 291 aa13.2□□□□□ -0.3
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