RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 HSPB2Q16082 182 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CDNFQ49AH0 187 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SEC16AO15027 2179 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TO15178 435 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 IGHMP01871 453 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FSTP19883 344 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 CD27P26842 260 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 AVPR2P30518 371 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CDAP32320 146 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PNLIPRP2P54317 469 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ATP1B3P54709 279 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 TLE3Q04726 772 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PPP1R1AQ13522 171 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CARD17Q5XLA6 110 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF546Q86UE3 836 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 BVESQ8NE79 360 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ST8SIA2Q92186 375 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NICN1Q9BSH3 213 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CST11Q9H112 138 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PPA2Q9H2U2 334 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 PRR13Q9NZ81 148 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RP1P56715 2156 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR5H14A6NHG9 310 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 A8MXK9 166 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM77I1YAP6 450 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF217O75362 1048 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TPPPO94811 219 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TIAF1O95411 115 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PMP2P02689 132 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TTRP02766 147 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FGF2P09038 288 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 CRABP1P29762 137 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CD96P40200 585 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CAPZA1P52907 286 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 BIDP55957 195 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 MPPED2Q15777 294 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ELP2Q6IA86 826 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 COX15Q7KZN9 410 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 KCTD9Q7L273 389 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SYT13Q7L8C5 426 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 LYPD6Q86Y78 171 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NAXDQ8IW45 347 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.48□□□□□ -1.37
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