RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319432.9

CCDC93-201, Transcript of coiled-coil domain containing 93, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CCDC93, Length 6,896 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93-201ENST00000319432 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 GABRB1P18505 474 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 PMCHP20382 165 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ZP3P21754 424 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 MEOX2P50222 304 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ACSM1Q08AH1 577 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RNF212Q495C1 297 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 Q6ZRG5 221 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ARSGQ96EG1 525 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TCTN2Q96GX1 697 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 KCNK5O95279 499 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SLC2A1P11166 492 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SRMP19623 302 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TAS2R30P59541 319 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 PPP1CAP62136 330 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SLC35A2P78381 396 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 H3F3AP84243 136 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 DPTQ07507 201 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 DDIT4LQ96D03 193 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 MED9Q9NWA0 146 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 LIPT1Q9Y234 373 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 HIVEP2P31629 2446 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 A0A1W2PR64 198 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 A0A1W2PRV1 198 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TP53I11O14683 189 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SSSCA1O60232 199 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SPINK4O60575 86 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SLC2A10O95528 541 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 MPC1LP0DKB6 136 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 AADACP22760 399 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 HTR3AP46098 478 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 PSMB3P49720 205 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RRADP55042 308 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 HACD4Q5VWC8 232 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ORAI1Q96D31 301 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RHOVQ96L33 236 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 HHATLQ9HCP6 504 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 THADAQ6YHU6 1953 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 OR5H14A6NHG9 310 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 A6NIZ1 184 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TCF21O43680 179 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 S100A7P31151 101 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SOX18P35713 384 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RAP1BP61224 184 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ZNF383Q8NA42 475 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 PFN4Q8NHR9 129 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 LOXL4Q96JB6 756 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 NRTNQ99748 197 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 VAMP8Q9BV40 100 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 FITM1A5D6W6 292 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 P2RY10O00398 339 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ALOX12BO75342 701 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 GPX5O75715 221 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 HLA-HP01893 362 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 WNT1P04628 370 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 HPNP05981 417 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 RFC3P40938 356 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 AQP6Q13520 282 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 MDGA2Q7Z553 956 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ZNF561Q8N587 486 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 GPR150Q8NGU9 434 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC93-201ENST00000319432 ASB11Q8WXH4 323 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms