RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QL1O75973 258 aa23.94■■□□□ 1.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MDP1Q86V88 176 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 SATL1Q86VE3 508 aa23.94■■□□□ 1.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa23.91■■□□□ 1.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ16Q9NPI9 418 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBASA2RRP1 2371 aa23.9■■□□□ 1.42
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL2L15Q5TBC7 163 aa23.88■■□□□ 1.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD17B8Q92506 261 aa23.88■■□□□ 1.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM19Q96E16 107 aa23.88■■□□□ 1.41
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