RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF680Q8NEM1 530 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ASH2LQ9UBL3 628 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CYB561P49447 251 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2G1P62253 170 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 BTNL8Q6UX41 500 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa22■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4F5Q8NH21 305 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TSLPQ969D9 159 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4F4Q96R69 305 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SRRQ9GZT4 340 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 DTYMKP23919 212 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 HRH1P35367 487 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL34P49207 117 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 LCN15Q6UWW0 184 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CD22P20273 847 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF10CO14798 259 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 AANATQ16613 207 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM74A1Q5RGS3 127 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 THEM4Q5T1C6 240 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 THNSL2Q86YJ6 484 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL2L10Q9HD36 194 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 DPTQ07507 201 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM178AQ8NBL3 297 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2AK2Q8NG84 335 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CPN1P15169 458 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF77Q15935 545 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SH2D5Q6ZV89 423 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 BPIFCQ8NFQ6 507 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ARSGQ96EG1 525 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SBK3P0C264 359 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ADPRHP54922 357 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SPANXN5Q5MJ07 72 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 R4GMQ9 66 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 E5RGE8 158 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 BSGP35613 385 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNAB1Q14722 419 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 NSG2Q9Y328 171 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC30A6NM36 301 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 MGMTP16455 207 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CTRB1P17538 263 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF90Q03938 601 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CTRB2Q6GPI1 263 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXW5Q969U6 566 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 S1PR5Q9H228 398 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR84Q9NQS5 396 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa21.98■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CYTIPO60759 359 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2B8PP59922 312 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RAC1P63000 192 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 LYG2Q86SG7 212 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TVP23CQ96ET8 276 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 JAM3Q9BX67 310 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SCO1O75880 301 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TPOP07202 933 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SELEP16581 610 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM268Q5VZI3 342 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHA2Q9HB19 425 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PLSCR3Q9NRY6 295 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC5A6Q9Y289 635 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPB2A8KAH6 182 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ICOSLGO75144 302 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 HNF1AP20823 631 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ARRB2P32121 409 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB1AP62820 205 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8G1Q15617 311 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPB2Q16082 182 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CA13Q8N1Q1 262 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SPACA5Q96QH8 159 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 OBP2AQ9NY56 170 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNG2Q9UJ96 466 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP98P52948 1817 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PI3P19957 117 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM185AQ8N0U4 392 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF727A8MUV8 499 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 DCTDP32321 178 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 GZMKP49863 264 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CAMKMTQ7Z624 323 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35D1Q9NTN3 355 aa21.97■■□□□ 1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC3BP05452 202 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms