RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 BTN1A1Q13410 526 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 KCNAB1Q14722 419 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GPX8Q8TED1 209 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MED9Q9NWA0 146 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 HPF1Q9NWY4 346 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SNAPINO95295 136 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IGHMP01871 453 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SFTPBP07988 381 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IL9P15248 144 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GUCA2AQ02747 115 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ROM1Q03395 351 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RSU1Q15404 277 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 Q5BKY6 102 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ASB10Q8WXI3 467 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ST8SIA2Q92186 375 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OXGR1Q96P68 337 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 EP400Q96L91 3159 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WZY1 265 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TAAR5O14804 337 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SCRG1O75711 98 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FAM57BQ71RH2 274 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZNF721Q8TF20 911 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NAT6Q93015 286 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OPN4Q9UHM6 478 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MEN1O00255 615 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 YKT6O15498 198 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 KIR3DL2P43630 455 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 DHODHQ02127 395 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CHAF1BQ13112 559 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SQSTM1Q13501 440 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CAMK2BQ13554 666 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RAET1LQ5VY80 246 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 LRRC75AQ8NAA5 344 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MR1Q95460 341 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 POM121CA8CG34 1229 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RAD51DO75771 328 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 VAMP5O95183 116 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IGHEP01854 428 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SERPINA5P05154 406 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 VWA2Q5GFL6 755 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FAM122BQ7Z309 247 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GDF15Q99988 308 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 METTL9Q9H1A3 318 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GAREM1Q9H706 876 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.95□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 F8W036 122 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ADRB1P08588 477 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CPT2P23786 658 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IL32P24001 234 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GJC3Q8NFK1 279 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR1L3Q8NH93 324 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ST8SIA4Q92187 359 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.94□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TMEM235A6NFC5 223 aa7.94□□□□□ -1.14
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