RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 TSPAN2O60636 221 aa14.67□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 BGLAPP02818 100 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 STARD6P59095 220 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CDC20BQ86Y33 519 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.67□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 TTC9Q92623 222 aa14.67□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 SLC25A45Q8N413 288 aa14.67□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.67□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.67□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 S100A11P31949 105 aa14.66□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 ACTG1P63261 375 aa14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CD276Q5ZPR3 534 aa14.66□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OTPQ5XKR4 325 aa14.66□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 LIPHQ8WWY8 451 aa14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 HSF1Q00613 529 aa14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 FAM122BQ7Z309 247 aa14.66□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.66□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 PCP4P48539 62 aa14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 C8orf44Q96CB5 159 aa14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 D6RAR5 112 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 GPANK1O95872 356 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 TAS2R20P59543 309 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SQSTM1Q13501 440 aa14.65□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OPN5Q6U736 354 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTCF-201ENST00000264010 F5H5P2 479 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 FBXO24O75426 580 aa14.64□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 NAGAP17050 411 aa14.64□□□□□ -0.07
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