RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 BLVRAP53004 296 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PPP1CBP62140 327 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 CLEC12BQ2HXU8 276 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 TMEM154Q6P9G4 183 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ST7LQ8TDW4 575 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 OTULINQ96BN8 352 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 PITX2Q99697 317 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 ELOVL3Q9HB03 270 aa19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SYF2-201ENST00000236273 M0R129 80 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ABHD16AO95870 558 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-13P01766 116 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 CD99P14209 185 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 PAICSP22234 425 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 GSTT1P30711 240 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TNK1Q13470 666 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 COLCA1Q6ZS62 124 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 DCXRQ7Z4W1 244 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 NAA40Q86UY6 237 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 C1orf174Q8IYL3 243 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 PQLC1Q8N2U9 271 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 SLC29A1Q99808 456 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TAAR3PQ9P1P4 343 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ZANQ9Y493 2812 aa19.07■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 CCDC182A6NF36 153 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 EI24O14681 340 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 PRODHO43272 600 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ACSM4P0C7M7 580 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ANOS1P23352 680 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ALKBH6Q3KRA9 238 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ZNF718Q3SXZ3 478 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHA8Q96JA3 519 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ATF6BQ99941 703 aa19.06■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 SPARCP09486 303 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 NUDT6P53370 316 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ECH1Q13011 328 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 KLHL12Q53G59 568 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 SLC35D3Q5M8T2 416 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 AADACL4Q5VUY2 407 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ARL9Q6T311 187 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 DPY19L4Q7Z388 723 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 CBR4Q8N4T8 237 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ZNF525Q8N782 197 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TCEANCQ8N8B7 351 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 INTS14Q96SY0 518 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 AMELYQ99218 206 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TEX12Q9BXU0 123 aa19.05■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 M0R233 179 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 NAT2P11245 290 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 MMP15P51511 669 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ALDH3A2P51648 485 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 PSG7Q13046 419 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 APOFQ13790 326 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 SLAMF6Q96DU3 332 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TEAD3Q99594 435 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TPK1Q9H3S4 243 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 MS4A5Q9H3V2 200 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 RIBC2Q9H4K1 309 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 DYNLRB1Q9NP97 96 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ENOPH1Q9UHY7 261 aa19.04■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 F5H5K5 113 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 H3BSA7 217 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 SELENOFO60613 162 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TUBG1P23258 451 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 OR6N2Q8NGY6 317 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TMEM163Q8TC26 289 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 ABHD6Q9BV23 337 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 RAB1BQ9H0U4 201 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 TUBG2Q9NRH3 451 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa19.03■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 A0A096LNT2 108 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPW3 197 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 C5orf63A6NC05 138 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 H7C1Q1 480 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 J3QW42 95 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 GCH1P30793 250 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 RGS6P49758 472 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 SELENOVP59797 346 aa19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
SYF2-201ENST00000236273 HAVCR1Q96D42 359 aa19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms