RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arrdc2Q9D668 407 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MecrQ9DCS3 373 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Paqr5Q9DCU0 330 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HikeshiQ9DD02 197 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DguokQ9QX60 277 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RlimQ9WTV7 600 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HaspinQ9Z0R0 754 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm45808A0A1B0GSH8 263 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr652B9EHE6 318 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mthfd2lD3YZG8 338 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm17555F6U8B9 371 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Raet1cO08604 253 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifi203O35368 408 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrygsO35486 178 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alox8O35936 677 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emc8O70378 207 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nme6O88425 189 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 M6prP24668 278 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrn4P59383 733 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psme3P61290 254 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Thbs3Q05895 956 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr90Q0VEL5 310 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasl10bQ5SSG5 203 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp30Q60585 533 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snap91Q61548 901 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LiphQ8CIV3 451 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AfmidQ8K4H1 305 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sla2Q8R4L0 259 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sav1Q8VEB2 386 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr970Q8VFN3 311 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GlyatQ91XE0 296 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DhddsQ99KU1 333 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AspnQ99MQ4 373 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dsn1Q9CYC5 348 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nde1Q9CZA6 344 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hormad1Q9D5T7 392 aa9.64□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC067074F6RXI4 2391 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smok3cA0A087WSF2 504 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4131A0A140LJ24 318 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv14-111A0A140T8P9 117 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1214A2ATG3 311 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rex2A2AWF2 685 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd35f3A2CGC2 496 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf551B2RUI1 696 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr86D3Z757 380 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20683H3BKJ1 410 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anxa3O35639 323 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-K1P01901 369 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il7rP16872 459 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map2k6P70236 334 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Polr1bP70700 1135 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UradQ283N4 178 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 InipQ3TXT3 104 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dcdc2Q5DU00 475 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc34a1Q60825 637 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Inca1Q6PKN7 231 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dact2Q7TN08 757 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpeb3Q7TN99 716 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1166Q7TR27 316 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrfn4Q80XU8 636 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam53bQ8BGR5 422 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp9Q8BIS1 454 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem221Q8K071 230 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kctd11Q8K485 232 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd276Q8VE98 316 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr434Q8VF17 321 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr47Q8VF18 321 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1079Q8VF52 315 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr266Q8VFC3 316 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr644Q8VH21 314 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Samd8Q9DA37 478 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbk1Q9WUN2 729 aa9.63□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav10nA0A075B622 114 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav10A0A075B642 114 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr465-ps1A0A0U1RPZ4 315 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5089A1L3C8 106 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr110A2RT31 317 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp456B2RUK9 458 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8180E9PXN0 145 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r106E9PY92 862 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C2cd2E9Q3C1 696 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr895L7N210 316 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CideaO70302 217 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc2a1P17809 492 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akr1b7P21300 316 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elk4P41158 430 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snrpd2P62317 118 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BglapP86546 95 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bglap2P86547 95 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcf7Q00417 419 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ascl1Q02067 231 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Calb2Q08331 271 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc138Q0VF22 680 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc22a15Q504N2 544 aa9.62□□□□□ -0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc44a5Q5RJI2 710 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms