RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	POU1F1	P28069	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MPI	P34949	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RY4	P51582	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTB	P60709	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	GALE	Q14376	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF212	Q495C1	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	RCN3	Q96D15	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ICMT	O60725	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SCG5	P05408	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	EPOR	P19235	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	STOM	P27105	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPA7	P48741	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MIER2	Q8N344	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL13	Q99616	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	REEP1	Q9H902	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM72	A0PK05	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		E7EVH7	732 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	STK16	O75716	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHG1	P01857	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PEX2	P28328	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	APOC4	P55056	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SKP2	Q13309	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	KDM8	Q8N371	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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