RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 MOGAT3Q86VF5 341 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TAMM41Q96BW9 452 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ALG12Q9BV10 488 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 EMC7Q9NPA0 242 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 C22orf46C9J442 243 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 H0YL77 283 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 CLPXO76031 633 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 MTPNP58546 118 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 GUCY1A3Q02108 690 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SELPLGQ14242 412 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 ALG10Q5BKT4 473 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SLC7A6Q92536 515 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 DYRK2Q92630 601 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 HAVCR1Q96D42 359 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 RBP7Q96R05 134 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 G3V4G9 280 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 H7C1C5 153 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 IFNL4K9M1U5 179 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PIP5K1CO60331 668 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV4-59P01825 116 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TNFRSF1BP20333 461 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 CPT2P23786 658 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TAS2R41P59536 307 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 LCN6P62502 163 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 OTPQ5XKR4 325 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 OR2T2Q6IF00 324 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 EPGNQ6UW88 154 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 MREGQ8N565 214 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM239Q8WW34 195 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 POLE4Q9NR33 117 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 C3orf80F5H4A9 247 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 F5H5P2 479 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SGCEO43556 437 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TSPAN19P0C672 248 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 CFHR2P36980 270 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 BPIFB3P59826 476 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 AGKQ53H12 422 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 MAGEB18Q96M61 343 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TECTBQ96PL2 329 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TBX15Q96SF7 602 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC30A6NM36 301 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PHYHO14832 338 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 MLNRO43193 412 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TOX4O94842 621 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 COX5BP10606 129 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TUBG1P23258 451 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 CTXN1P60606 82 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SYT9Q86SS6 491 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 MICU2Q8IYU8 434 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 C10orf82Q8WW14 230 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PTP4A1Q93096 173 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 EBF4Q9BQW3 602 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms