RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566877.5

RAB27A-208, Transcript of RAB27A, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB27A, Length 663 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB27A-208	ENST00000566877	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	KRT73	Q86Y46	540 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SLC43A2	Q8N370	569 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SCAI	Q8N9R8	606 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SYT14	Q8NB59	555 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	OR51A7	Q8NH64	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	NSMAF	Q92636	917 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	MCHR2	Q969V1	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	FBXO17	Q96EF6	278 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SGTB	Q96EQ0	304 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	OXGR1	Q96P68	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CDRT15	Q96T59	188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	DDO	Q99489	341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	GLRX2	Q9NS18	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	EMC3	Q9P0I2	261 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CACNG2	Q9Y698	323 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877		H0YIZ8	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	PTP4A3	O75365	173 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SERPINB7	O75635	380 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	FCN3	O75636	299 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SOX14	O95416	240 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	LY6G6D	O95868	133 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CLPTM1	O96005	669 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CLU	P10909	449 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ZNF35	P13682	527 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ZNF43	P17038	809 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	AHCY	P23526	432 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	RRM2	P31350	389 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	THBS4	P35443	961 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	MPV17	P39210	176 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ALDH3B1	P43353	468 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	GSS	P48637	474 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CSNK1A1	P48729	337 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	COPZ1	P61923	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SPIB	Q01892	262 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	PRKCD	Q05655	676 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CCNI	Q14094	377 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	KEAP1	Q14145	624 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	GNA13	Q14344	377 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	KRT72	Q14CN4	511 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	MAPRE2	Q15555	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	C10orf128	Q5T292	105 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	GLYAT	Q6IB77	296 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	LCN8	Q6JVE9	175 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	KRT80	Q6KB66	452 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	PXK	Q7Z7A4	578 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	UEVLD	Q8IX04	471 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	SVOPL	Q8N434	492 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RAB27A-208	ENST00000566877	ZNF611	Q8N823	705 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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